T細胞在胸腺中發(fā)育成熟過程中，TCR基因按照一定的順序發(fā)生重排。TCR基因的重排順序和表達與免疫球蛋白基因的重排和表達十分相似。在基因組中的識別序列包括了一個保守的七聚體和九聚體，七聚體與九聚體之間含有一個不保守的12堿基對或23堿基對間隔序列（spacer sequence)。
TCRβ鏈基因座的重排要先于α鏈。首先是一個Dβ片段與一個Jβ片段連接，然后D-J與一個Vβ片段相連，完成了VDJ基因的重組。TCRβ鏈初級的RNA轉錄本在重組的VDJ和C基因之間含有內(nèi)含子。VDJ與Cβ1或Cβ2的重排是隨機的，目前尚未發(fā)現(xiàn)Cβ類似Ig重鏈類別轉換那樣從一個Cβ基因轉換到另一個Cβ基因上。在小鼠Cβ2基因的3′端推測有一個增強子。醫(yī)學全在線www.med126.com
TCRβ鏈基因的功能性重排和表達，誘導了TCRα基因的重排。α鏈基因的重排與β鏈相似，由于α鏈基因不存在D片段，故α鏈基因只有V-J的連接。小鼠Vα轉錄起始點的5′端有一個啟動子，Cα基因的3′端也有一個增強子。此外，靠近α鏈增強子處有“靜息順序”（silencer sequences)，這些順序可抑制非T細胞或者是TCRγδT細胞中α鏈的轉錄。由于α鏈只有一個Cα基因，因此一旦初始的轉錄本形成后，經(jīng)過RNA加工只能產(chǎn)生一種完整的α鏈mRNA。
如同Ig基因的重排和表達，TCRα和β鏈基因的重排和表達也有等位基因排斥現(xiàn)象（al-lelicexclusion),如果在一條染色體上TCR基因的重排是有效的，那末就可以抑制另一條染色體相應等位基因座的重排。當一條染色體上α鏈或β鏈基因座的重排、轉錄或翻譯無效時，則另一條染色體上相應α或β鏈相應的等位基因座開始發(fā)生重排。如果兩條染色體上TCRα或β鏈基因重排都無效，則未成熟的T細胞死亡。
