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藥理學-電子教材:第十八章 病理學常用新技術原理及應用

藥理學:電子教材 第十八章 病理學常用新技術原理及應用:第十八章 病理學常用新技術原理及應用_____________________________________________________________________________組織與細胞化學技術免疫組織與細胞化學技術原理與方法免疫組織化學技術的主要步驟與常用標記物常用免疫組化染色方法免疫組化染色過程中需注意的有關事項免疫組化在腫瘤診斷和鑒別診斷中的應用電子顯微鏡技術透射式電鏡掃描電鏡

第十八章  病理學常用新技術原理及應用

_____________________________________________________________________________


組織與細胞化學技術

免疫組織與細胞化學技術

原理與方法

免疫組織化學技術的主要步驟與常用標記物

常用免疫組化染色方法

免疫組化染色過程中需注意的有關事項

免疫組化在腫瘤診斷和鑒別診斷中的應用

電子顯微鏡技術

透射式電鏡

掃描電鏡

共聚焦激光掃描顯微鏡技術

生物芯片技術

基因芯片

蛋白芯片

組織芯片

激光顯微切割技術

顯微切割的方法

顯微切割的應用

原位分子雜交技術

熒光原位分子雜交染色體分析技術

簡介

探針

FISH技術系列

比較基因組雜交技術

流式細胞技術

組織培養(yǎng)與細胞培養(yǎng)技術

形態(tài)測量與圖像分析技術

目鏡測微器定量分析

計算機圖像分析系統(tǒng)


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病理學的發(fā)展離不開病理技術的進步,縱觀病理學的發(fā)展史,從器官病理學、細胞病理學、超微病理學、免疫病理學、分子病理學、遠程病理學及當今的計算機網(wǎng)絡信息病理學。每一個發(fā)展階段都有新技術的革命。新技術使我們對疾病認識更加深入切實。從大體、細胞、超微結構、分子基因水平逐步深入,正如病理學前輩們所說:技術是病理學之母。

病理學技術包括傳統(tǒng)病理學技術和現(xiàn)代新技術。有人體病理學技術和實驗病理學技術,二者相互滲透,互為促進,傳統(tǒng)的福爾馬林固定、石蠟切片、HE染色是病理學的基本技術,已廣泛應用于基礎和臨床病理學工作。根據(jù)科研的發(fā)展,臨床病理學的需要,又不斷產生新的技術。作為當代的醫(yī)學生,要適應技術的發(fā)展進步、了解病理學研究和臨床實踐中的一些新技術是必不可少的,F(xiàn)介紹一些新技術方法,供同學們在以后的學習工作中參考。

第一節(jié) 組織與細胞化學技術

組織與細胞化學技術(histochemistry andcytochemistry technique)是研究組織與細胞顯微結構和超微結構的化學組成及其定位的科學。主要研究對象是生物大分子(如核酸、蛋白質、酶、多糖和脂類等)在細胞內的結構和功能活動中的分布與變化以及亞細胞組分和細胞器在整個生命活動中的作用等。

細胞化學方法能夠對細胞內的各種成分進行定性、定位、定量研究,包括懸浮胸腹水細胞、血液細胞以及體外培養(yǎng)細胞均能產生同樣良好的效果。目前,用細胞化學技術所能顯示的化學成分有蛋白質(顯示某些特定蛋白、某些氨基酸或功能基)、核糖核酸(RNA)和脫氧核糖核酸(DNA)、糖類(如糖原、粘多糖和糖脂等)、脂類(如中性脂肪、磷脂和固醇等)、酶(包括水解酶如磷酸酶)、特異抗原(其化學本質可能是多肽、蛋白、糖蛋白等)、無機鹽和微量元素(如鐵、銅、、鉆、鎂等)。

細胞化學染色的原理是細胞中的化學成分和其相應的底物呈一系列的化學反應,形成于顯微鏡下可見到的反應產物。常見有:

1.孚爾根反應法(feulgen reaction)顯示DNA呈現(xiàn)紫紅色。

2.甲綠-派郎寧法(methyl Green-Pyroninmethod)顯示核酸(甲綠染DNA呈現(xiàn)綠色,派郎寧染RNA呈現(xiàn)紅色)

3.蘇丹Ⅲ冰凍切片染色顯示中性脂肪呈現(xiàn)橘紅色。

4.普魯士藍反應顯示組織中含鐵血黃素。

5. 嗜銀染色,顯示彈力纖維、基底膜及尼氏小體和神經纖維等(圖18-1)。

6.過碘酸雪夫反應(periodic acidschiffreaction, PAS)顯示糖原和其它多糖物質為紫紅色(圖18-2)。

 圖18-1嗜銀染色,大鼠腦神經細胞及突起陽性  圖18-2 胃賁門腺體胞漿呈PAS陽性

第二節(jié)  免疫組織與細胞化學技術

一、原理與方法

免疫組織與細胞化學技術(immunohistochemistryand immunocytochemistry technique)是從組織與細胞化學方法衍生出來的。是在單克隆抗體技術產生后,利用免疫學原理,將抗原抗體反應應用于組織細胞化學而進一步通過級連放大,增加敏感性。最后用辣根過氧化物酶顯色。從而定位組織細胞中抗原(蛋白 多肽、酶)等多種基因產物的特異方法。在病理學外檢工作中可用于對不同來源,HE難以診斷的腫瘤進行確診和鑒別診斷。

其基本原理是應用抗原與抗體接觸后可形成“抗原-抗體復合物”的化學反應,以檢測組織或細胞內抗原(或抗體)的技術。

二、免疫組織化學技術的主要步驟與常用標記物

(一)主要步驟

①提取抗原;②用免疫原免疫動物()制備抗血清(多克隆抗體) 或免疫動物(鼠)后,用雜交瘤技術制備單克隆抗體;③純化抗體;④抗體標記組織切片;⑤染色反應;⑥觀察結果。

(二)常用標記物

1.酶 為最常用的標記物。作為標記的酶應具有以下條件:①底物是特異性的,且易于顯示;②酶反應產物穩(wěn)定,不易擴散;③容易獲得純酶分子且較穩(wěn)定;④酶標記抗體后,不影響兩者的活性;⑤被檢組織中不應存在內源性相同的酶或其底物。常用的標記酶有辣根過氧化物酶(HRP)、鹼性磷酸酶(AKP)、葡萄糖氧化酶(GOD)等。

2.熒光素 指在高能量光波的激發(fā)下能產生熒光的物質。常用的有異硫氰酸熒光素(FITC)、四甲基異硫氰酸羅達明(TRITC)。

3.生物素 其與卵白素的親和力明顯高于抗原抗體的結合力。

4.金屬標記物 如鐵蛋白和膠體金。多用于免疫電鏡。

三.常用免疫組織化學染色方法

(一)直接法

將熒光素(免疫熒光法)或酶直接標記在第一抗體上,以檢查相應的抗原。直接法具有特異性強的優(yōu)點,但敏感性差,耗費抗體多。

(二)間接法

先用熒光素或酶標記第二抗體,一抗為特異性抗體, 二抗僅有種屬特異性。

特點:  ⑴ 預先標好二抗,較方便;

⑵ 比直接法敏感,但仍差。

(三)PAP法與雙PAP法:

既過氧化物酶抗過氧化物酶復合物法(Peroxidase AntiperoxidaseComplex, PAP)

先將過氧化物酶(HRP)免疫兔/羊/鼠,制成兔/羊/鼠抗HRP;然后再與HRP結合,形成一個穩(wěn)定的多角形結構(PAP)。

特點:①敏感性較高;②背景染色低(相對);③雙PAP敏感性更高,但背景相對較重。

(四)ABC法

既卵白素-生物素過氧化物酶復合物法(Avidin Biotin-peroxidaseComplex,ABC)

利用卵白素與生物素特有的高度親和力,先將生物素與酶結合形成生物素化HRP,再以生物素化HRP與卵白素按一定比例混合,形成一個復合物;同時先將二抗生物素化。 

1.如將卵白素換成鏈霉親和素,則為:

  SABC法:(StreptAvidin Biotin-peroxidaseComplex)

2.將鏈霉親和素和生物素先連結起來,則稱:

  LSAB法:labelledStreptAvidin-Biotin

3.用鏈霉素抗生物素蛋白連結辣根過氧化物酶,則為:

  S-P法:(StreptAvidin Peroxidaseconjugataed method)

  若用堿性磷酸酶標記鏈霉卵白素則稱SAP法。

  若分別用堿性磷酸酶和辣根過氧化物酶標記鏈霉卵白素,則稱DS法。

特點:  ①敏感性高,(比PAP高8~40倍);②背景淡,鏈霉親和素更好;③方法較簡便,時間較短;④應用范圍廣,也可用于原位雜交和免疫電鏡。

四.免疫組織化學染色過程中需注意的有關事項

1.正確設置免疫組織化學的對照

對照原則:首先對照第一抗體;替代對照要注意相同的原則;陽性結果陰性對照,陰性結果陽性對照;染色清晰,定位準確(圖18-3、18-4、18-5)。

圖18-3食管鱗癌 E-cad膜強陽性   圖18-4 神經膠質細胞GFAP胞漿胞膜陽性  圖18-5肺硬化性血管瘤 TIF-1核陽性

陰性對照

(1)空白對照:用PBS置換第一抗體;

(2)血清替代對照:用同種動物的正常血清代替第一抗體;

(3)抑制對照:用未標記的抗體先和相應的抗原結合;

(4)吸收對照:用純化的抗原對抗體先行吸收;

陽性對照:用已知或已被實驗證明為陽性的組織;

自身對照:利用組織切片內的各種不同的組織成分作對照。 

2.假陽性反應:

⑴ 非特異性反應:邊緣現(xiàn)象、皺折和刀痕、出血和壞死等;

⑵ 內源性過氧化物酶:紅細胞、炎細胞、退變壞死細胞和某些腺上皮分泌物,以及某些富含過氧化物酶的組織,如腦、肝等;

⑶ 抗體的交叉反應:抗體本身含有與人體組織發(fā)生交叉反應的成分;  

⑷ 試劑濃度過高或失效。

3.假陰性反應:

⑴ 組織固定不當或固定時間過長;

⑵ 抗體效價過低或久置失效;

⑶ 組織中抗原被粘稠基質或分泌物阻隔;

⑷ DAB或H2O2的濃度不當。 

五、免疫組織化學在腫瘤診斷和鑒別診斷中的應用

(一)在腫瘤診斷中應用免疫組織化學染色的原因

1.在常規(guī)病理活檢中,通常有5~10%的疑難病例不能明確診斷。

2.形態(tài)結構相似的腫瘤可為不同的組織來源(如未分化癌和惡性淋巴瘤)因而難于識別,給治療帶來困難。  

3.一些轉移性腫瘤常常缺乏特有的組織學特征,因而無法確定其原發(fā)病灶(如甲狀腺癌前列腺癌)。 

4.通過一些反映細胞增殖和與腫瘤惡性程度有關的標記物協(xié)助識別腫瘤的良惡性。

(二)各種不同組織及其腫瘤常見的標記物

免疫組織化學最突出的優(yōu)點是能在微觀世界原位地確定組織及細胞結構的化學成分,由于其方法簡便且可重復性強,目前已得到廣泛的應用,并正繼續(xù)向著更微細、更精確的原位分子雜交和免疫電鏡方向發(fā)展,向著分子病理學的領域推進。

表18-1 各種不同組織及其腫瘤常見標記物

標記物

抗體

常見陽性腫瘤

上皮標記

廣譜細胞角蛋白(CK/AE1/AE3)

上皮性腫瘤

上皮細胞膜抗原(EMA)

上皮源性腫瘤,尤其是低分化腺癌

軟組織標記

廣譜肌動蛋白(Actin)

肌源性腫瘤

結蛋白(Desmin)

肌源性腫瘤(肌細胞分化最早的標記)

波形蛋白(Vimentin)

間葉源性腫瘤

神經內分泌標記

突觸素(SY)

嗜鉻細胞瘤、節(jié)細胞神經瘤、APUD瘤

膠質纖維酸性蛋白(GFAP)

星形膠質細胞瘤

S-100蛋白

神經源性腫瘤,惡黑、脂肪肉瘤

神經元特異性烯醇化酶(NSE)

神經內分泌腫瘤(特異性較差)

淋巴造血組織標記

白細胞共同抗原(LCA)

造血組織腫瘤(造血細胞的特異性標記)

T細胞CD3

T細胞淋巴瘤

B細胞CD20

B細胞淋巴瘤

細胞周期素標記

周期素B1(Cyclin B1)

G2期和M期

周期素D1 (Cyclin D1)

G1期進入S期重要調控因子

周期素D2(Cyclin D2)

G1期進入S期重要調控因子

Ki-67 Antigen

S、G2、M期(G0期缺如)

增殖細胞核抗原(PCNA)

增殖細胞(S期、G1期、G2初期)

第三節(jié) 電子顯微鏡技術

電子顯微鏡(electron microsocope)簡稱電鏡,是以電子束為照明源,通過電子流對生物樣品的透射以及電磁透鏡的多級放大后的熒光屏上成像的大型精密儀器。按工作原理和用途的不同可分為透射式電鏡(transmission electronmicroscope, TEM)和掃描式電鏡(scanning electron microscope, SEM)二種基本類型。

一.透射式電鏡

主要用于觀察細胞內部的微細結構,由于電子的穿透力較弱,故用于透射電鏡觀察的標本必須切成50~100nm的超薄切片。換句話說,一個細胞要被切成100~200個薄片才適于在透射電鏡下觀察。樣品在被超薄切片之前,一般要經過固定、脫水和包埋等處理,在切片之后還要經過染色等處理才能進行觀察。

超薄切片術(techniques of ultrathinsection)是最基本的電鏡樣品制備技術,其基本過程同石蠟切片大體相似,包括取材、固定、漂洗、脫水、滲透與聚合、切片和染色等多個環(huán)節(jié),但操作過程比石蠟切片更為細致與復雜。為了獲得理想的超薄切片,操作者必須認真對待每一步驟,任何環(huán)節(jié)的疏忽都可能導致制樣的失敗。

合格的超薄切片樣品應該達到以下基本要求:①切片的厚度應在50nm左右,不能超過100nm,以獲得較高的分辨率和較高的反差;②切片應能耐受電子束的強烈照射而不發(fā)生破裂、變形;③細胞超微結構保持良好,沒有明顯的物質凝聚和丟失。

電子顯微鏡技術使病理學對疾病的認識,從組織細胞的光鏡水平深入到細胞內的超微結構水平,它可觀察細胞內的細胞器、細胞骨架或大分子水平的變化,在疾病的病理診斷中,電鏡主要用于腎臟的細針穿刺活檢標本,來進行腎小球腎炎的分型。在腫瘤診斷中,電鏡在確定腫瘤細胞的組織發(fā)生、類型和分化程度上起著重要作用(圖18-6)?筛鶕(jù)各種腫瘤細胞的超微結構特點來協(xié)助區(qū)別分化差的癌和肉瘤、各種梭形細胞惡性腫瘤、各種惡性小圓細胞腫瘤、各種神經內分泌腫瘤及惡性黑色素瘤等。其方法包括負染色技術、冷凍蝕刻技術、電鏡細胞化學技術、電鏡X射線顯微分析技術、電鏡放射自顯影技術等在疾病的研究中已得到廣泛的應用。

  

二.掃描電鏡

掃描電子顯微鏡就是用聚得很細的電子束流照射要檢測的樣品表面。由于電子束與樣品的相互作用產生各種信息然后通過不同的檢測器接收相應的信息,經過處理后顯示出樣品的各種特征。

掃描電鏡具有以下特點:能夠直接觀察樣品的表面的結構;樣品制備過程簡單,不用切成超薄切片;可以從各種角度對樣品進行觀察;景深大,圖像富有立體感;圖像的放大范圍廣,分辨率也比較高(圖18-7);電子束對樣品的損傷與污染程度較。辉谟^察形貌的同時,還可利用從樣品發(fā)出的其他信號作微區(qū)成分分析。

采用冷凍樹脂割斷法將細胞打開,可以觀察到細胞的內部結構。用鑄型技術研究空腔臟器,尤其是血管系統(tǒng)復雜的立體分布。還可用鹽酸化學消化法觀察細胞的基底面及深層細胞表面結構。

第四節(jié) 共聚焦激光掃描顯微鏡技術

共聚焦激光掃描顯微鏡(confocal laser scanningmicroscopy)可以從組織細胞水平直接進入亞細胞水平觀察,且可利用計算機及圖像處理系統(tǒng)對組織,細胞及亞細胞結構進行斷層掃描,三維立體空間結構再現(xiàn),將形態(tài)學研究從平面圖像水平提高到三維立體水平,圖像清晰鮮艷;還可在觀察培養(yǎng)細胞形態(tài)結構的同時,直接顯示培養(yǎng)活體細胞內的代謝m.jfsoft.net.cn/sanji/變化(圖18-8),可以說病理學及其它形態(tài)學研究將出現(xiàn)一個全新的時代。

 

 

 

 


圖18-8  共聚焦激光掃描圖

左 體外培養(yǎng)神經細胞;中 花粉顆粒三維圖像;右 神經細胞DNA含量熒光強度圖

第五節(jié) 生物芯片技術

生物芯片技術(biochip technique)是將大量具有生物識別功能的分子或生物樣品有序地點陣排列在支持物上并與標記的檢體分子同時反應或雜交,通過放射自顯影、熒光掃描、化學發(fā)光或酶標顯示可獲得大量有用的生物信息的新技術。生物芯片技術包括基因芯片、蛋白質芯片、細胞芯片、組織芯片、以及元件型微陣列芯片、通道型微陣列芯片、生物傳感芯片等新型生物芯片。可對DNA、RNA、多肽、蛋白質、細胞、組織以及其它生物成分進行高效快捷的測試和分析。

一、基因芯片

基因芯片(genechip)是指采用原位合成或顯微打印方法,將大量DNA探針固化于支持物表面上,產生二維DNA探針陣列,然后與標記的樣品進行雜交,通過檢測雜交信號來實現(xiàn)對生物樣品快速、并行、高效地檢測(圖18-9)?勺詣、快速地檢測出成千上萬個基因的表達情況,為基因診斷、藥物篩選以及新基因發(fā)現(xiàn)提供了有力的手段。    

圖18-9 cDNA基因芯片檢測mRNA表達

二、蛋白芯片

蛋白芯片技術的基本原理是將各種蛋白質有序地固定于滴定板、濾膜和載玻片等各種載體上成為檢測用的芯片,然后,用標記了特定熒光素的蛋白質或其他成分與芯片作用,經漂洗將未能與芯片上的蛋白質互補結合的成分洗去,再利用熒光掃描儀或激光共聚焦掃描技術,測定芯片上各點的熒光強度,通過熒光強度分析蛋白質與蛋白質之間相互作用的關系,由此達到檢測多種蛋白質及其功能的目的。如抗體芯片可排列數(shù)百種單克隆抗體,通過這張芯片,人們在一次實驗中就能夠比較幾百種蛋白的表達變化。對于診斷疾。喝鐐魅静 ⒛[瘤、遺傳病等臨床工作以及信號傳導、細胞周期調控、細胞結構、細胞凋亡和神經生物學等基礎研究都具有廣泛的應用前景

三、組織芯片

組織芯片又稱組織微列陣(tissue microarray) 是將數(shù)十個 數(shù)百個乃至上千個小的組織片整齊的排列在一起到載玻片上,形成微縮的組織切片(圖18-10)。

圖18-10  組織芯片

其特點有:①體積小信息含量高.可根據(jù)不同需要進行組合和設計;②即可用于形態(tài)學觀察也可用于免疫組織化學染色。原位雜交, FISH 等原位組織細胞學觀察和研究;③高效快速,低消耗,自身內對照和可比性強,節(jié)時、省力、少材、高效利用庫存蠟塊腫瘤標本的新方法。一個蠟塊可連續(xù)切片200張,以供原位分析腫瘤相關基因DNA及其表達的mRNA和蛋白質,熒光原位分子雜交(FISH),mRNA原位雜交、免疫組化三種方法可同時在一個芯片蠟塊的連續(xù)組織切片中應用。

因而可提高實驗效率,一張組織芯片上可列陣數(shù)十至數(shù)百個樣本。實驗條件最大程度上保持一致,有助于減少實驗誤差。另外

一個組織芯片蠟塊可連續(xù)切200張片,可進行許多分子標記檢測。

最大限度地利用有限的標本資源,尤其是少見的病例標本,最小破損原有蠟塊。

可同時檢測一種腫瘤不同階段的基因表達狀況。能在一張片上同時看到一個腫瘤組織在原位、轉移 、復發(fā)中的基因擴增情況。

第六節(jié) 激光顯微切割技術

顯微切割(micro-desection)就是在顯微鏡下用手工或儀器采樣的方法從組織切片或細胞涂片上將所要研究的形態(tài)或表型相同的細胞從組織三維構造中分離出來,獲得純的細胞群(pure cell population),以備進一步作分子水平的研究(圖18-11)。顯微切割技術的貢獻就是克服了組織的細胞成分非常繁雜這一重大的缺點。

  

一、顯微切割的方法

1.材料來源

微切割可用于福爾馬林固定石蠟包埋的組織切片、冰凍切片、培養(yǎng)細胞和細胞涂片。但所用載玻片不準涂抹任何粘附劑,常用的組織切片是HE染色的常規(guī)石蠟切片(厚5μm)。

2.切割及細胞采集方法

微切割及細胞采集方法大體上可分為手工操作和儀器操作兩大類。兩者各有長短。從兩個方面評價這些方法,一是準確性,即有無雜細胞污染;二是它的效率,能否在較短時間內采集到足夠的細胞;當然也要考慮方法所需費用。

(1)手工操作  就是用消毒的細針或刀片搔刮組織切片(厚5~15μm)上的細胞,并將其移至Eppendorf管中。

(2)儀器操作  利用激光進行微切割和細胞采集,其特點是微切割的精度高,可進行單個或幾個至數(shù)十個細胞的切割,可獲得很純的細胞群體,并適用于各種組織材料;再就是效率高,但儀器價格昂貴。具體又有4種不同的方法:①激光微光束微切割 ② 激光加壓彈射③貼于膜上的原組織微切割 ④激光俘獲微切割。

二、顯微切割的應用

1.細胞基因突變及微衛(wèi)星變異的研究

2.細胞基因拷貝數(shù)的變化和甲基化水平的檢測

3.定量RT-PCR

4.比較基因組雜交

5.cDNA微陣列(芯片)

 

第七節(jié) 原位分子雜交技術

原位核酸分子雜交(in situ hybridization, ISH)是應用特定標記的已知核酸探針與組織或細胞中待測的核酸按堿基配對的原則進行特異性結合,形成雜交體,雜交后的信號可以在光鏡或電鏡下進行觀察。由于核酸分子雜交的特異性強、敏感性高、定位精確、并可半定量,因此該技術已廣泛應用于生物學、醫(yī)學等各個領域的研究之中(圖18-12)。     圖18-12肺腺癌

  β-catmRNA的表達,原位雜交

  

 

第八節(jié) 熒光原位分子雜交染色體分析技術

一、簡介(introduction)

染色體原位分子雜交技術(Chromsome Analysis byFluorescence in situ Hybridization)的發(fā)展為研究染色體上DNA的序列提供了一個最直接的方法。具有經濟、安全、快速、穩(wěn)定,靈敏度高等優(yōu)點,多彩FISH可在同一核內顯示兩種或多種序列,還可對間期核染色體進行研究(圖18-13);應用不同的探針可顯示某一物種的全部基因,某一染色體染色片段及單拷貝序列;結合共焦激光顯微鏡可對間期核及染色體進行三維結構研究,精確檢測雜交信號。

二、探針(probes)

1.基因組探針(genomic probe):

人類基因組內一些高頻率的重復序列,在進化上很少具有保守性。若以基因組DNA作為探針,這些存在于探針和靶細胞順序中的高度重復序列之間會首先退火結合,越過那些保守的和單一的序列,故雜交會呈現(xiàn)出種特異性。利用這類探針在人鼠雜交細胞中可特異顯示人的遺傳物質。

2.染色體特異性序列探針(probe recognizing chromosome specificsequences):

目前在人幾乎所有染色體中已經克隆出一些重復序列,重復一百到五千次不等,各具染色體特異性。大多在某一染色體的著絲粒區(qū)或異染色質區(qū)產生致密的雜交帶。從而可特異性地識別某一染色體。

3.染色體文庫探針(chromosomelabraries probe):

染色體文庫收集人類單條染色體的DNA作為探針,又稱整體染色體探針。單條染色體的獲得一般有兩種方法:來自僅攜有某一條人類染色體的體細胞雜交株,或經流式細胞分類儀從染色體懸液中分離

4.單一序列探針(single-copysequences probe): 

  FISH有一弱點,就是要求探針足夠大,探針越小,雜交位點檢出率就越低。欲利用FISH檢測存在基因組內的單一序列基因,最有效的方法是應用含大插入片段的克隆載體,如全Cosmids(載約40kb的插入片段),更大的YAC載體(載100-800kb插入片段)。若掌握好,小到2kb的質粒探針亦可用FISH方法定位,但效率較低。

三、FISH技術系列

1.24mFISH核型分析技術

24色mFISH是近年建立的一種新技術。其原理是使用5種熒光染料按比例標記探針,雜交后形成24條染色體各自呈現(xiàn)特異的熒光色彩以供核型分析(圖18-14)。為研究人員提供了更豐富詳盡的細胞遺傳學信息,包括確定標記染色體的來源、檢測微小的染色體易位和檢測復雜的染色體易位,尤其為腫瘤細胞染色體分析提供了全新、高效的方法 。

2.原位雜交顯帶技術(in situ hybridizationbanding,ISHB)

為了準確定位原位雜交部位所處染色體及其區(qū)帶,染色體必須顯帶。但無論是先雜交后顯帶,還是先顯帶后雜交,雜交與顯帶過程會互相影響效果。后來人們注意到,人類短間隔插入重復序列中的一種Alu家族,Alu片段約300bp長,在基因組中重復約九十萬次,平均間隔3-4kb就插入一個。有人利用部分Alu序列作為引物,用PCR方法擴增Alu之間的DNA,稱Alu-PCR法。但Alu序列在基因組內分布不是隨機的,有些區(qū)域比較密集,有些區(qū)域較稀疏。只有前者才有PCR產物。人們用Alu-PCR產物作為探針與人類染色體標本雜交,結果得到類似R帶的熒光帶型。故人們在進行基因定位時,只需將目的探針與Alu-PCR探針同時應用,用不同顏色的熒光標記,就可同時顯示雜交信號和染色體帶型。

3FISH基因定位(FISH mapping)

基因定位時,不但需要確定某段靶序列在染色體上的位置,尚需確定兩個或兩個以上靶序列在線性DNA分子的排列次序和距離,才能繪出基因圖。一般用同位素雜交:先確定每一靶序列在中期染色體上的位置,然后根據(jù)它們到端粒的距離確定出線形排列次序。而用FISH方法,兩種或兩種以上的探針能同時與中期染色體雜交,只要根據(jù)兩種顏色雜交位點的相互位置,就能直接確定次序。但中期染色體是線形DNA分子經過折疊和包裝后形成的,若兩個靶序列相距很近,例如間距小于1Mbp,受包裝過程的影www.med126.com響,它們在線形DNA分子上的排列與在中期染色體上的排列不一定相同,甚至可能完全相反。學者們發(fā)現(xiàn),靶序列之間在間期核的平均相對距離與它們在線形DNA分子上的距離呈正相關。利用間期核FISH分析不但能排除染色體包裝的影響,還能提高測距的分辨率(圖18-15)。

4.FISH的應用

(1)基因定位與基因制圖(genemapping) 原理前面已敘述。FISH已經極大地加速了人類基因定位和基因制圖的進程。

(2)基因診斷(genediagnosis) 精確、直觀、明了

(3)間期細胞遺傳學(interphasecytogenetics)

(4)FISH在腫瘤生物學中的應用 

①腫瘤細胞遺傳學(onco-cytogenetics);②基因定位:FISH可用于分離出的癌基因與抑癌基因初步定位;③病毒基因插入基因組部分的檢測:雖然逆轉錄病毒以激活原癌基因為主,也有像腺病毒、HPV、SV40等病毒以蛋白產物與抑癌基因蛋白產物相互作用而誘導細胞轉化。但病毒基因特別是DNA病毒多有病毒基因成分插入到人基因組。利用FISH可以檢測到病毒整合到人基因組中的情況,對深入研究病毒致癌機理,以及檢測、防治腫瘤均具有重要意義;④基因的擴增與缺失:原癌基因的激活與抑癌基因的失活是目前腫瘤研究的熱點。已知原癌基因的激活方式有:突變、基因擴增、易位、病毒序列插入。抑癌基因的失活方式有:點突變、基因缺失。FISH為研究基因的擴增和缺失提供了新的方法,能將基因擴增和染色體重復分開。

第九節(jié) 比較基因組雜交技術

比較基因組雜交技術(comparative genomehybridization,CGH)。

 

圖18-16   食管癌細胞系CGH圖

其基本原理是用不同的熒光染料分別標記正常人基因組DNA與腫瘤細胞DNA,然后與正常人中期染色體雜交,通過檢測染色體上兩種熒光(紅、綠)的相對強度比率,兩組DNA相異部分會顯出顏色偏移,可計算出DNA的缺失與放大,從而了解腫瘤組織DNA拷貝數(shù)的改變,并能同時在染色體上定位(圖18-16)。這樣的方法使我們只要從新鮮組織或石蠟包埋腫瘤組織中提取少量DNA,就可進行全基因組檢測。應用CGH技術檢測癌變過程中的不同階段,腫瘤進展的不同時期及不同類型腫瘤的非隨機性染色體改變,有助于從分子細胞遺傳學角度了解腫瘤的發(fā)生發(fā)展,對發(fā)現(xiàn)腫瘤遺傳學標記,初步查尋腫瘤相關基因的位置均具有重要意義。其對檢測原癌基因擴增較為靈敏,但對檢測基因缺失敏感性則相對較弱。

第十節(jié) 流式細胞技術

流式細胞術(flow cytometry, FCM)是一種單細胞定量分析和分選的新技術,可對單個細胞逐個地進行高速準確的定量分析和分類。

流式細胞儀的主要工作原理是讓熒光染色細胞在穩(wěn)定的液流推動裝置作用下通過直徑為50~100m的小孔并排列成單行,每個細胞依次而且恒速通過激光束的照射區(qū),細胞受激光照射后發(fā)生散射光和熒光。通過檢測散射光可知細胞的體積,檢測熒光可知細胞DNA或RNA的含量。細胞樣品被檢測后即形成一連串均勻的液滴,其形成速度約每秒3萬個,而細胞通過小孔(噴嘴)的速度在每秒2000個以下。由此計算,平均每15個液滴中有一個液滴包有細胞,而其它液滴無細胞。由于液滴中的細胞是已被測定的細胞,因而,如其特性與被選定要進行分選的細胞特性相符,則儀器在含有這個細胞的液滴形成時就使其帶有特定的電荷;否則,液滴不帶電荷。帶有電荷的液滴向下落入偏轉板的高壓靜電場時,依據(jù)自身所帶電荷性質發(fā)生向左或向右偏轉,落入各自的收集容器中。不帶電荷的水滴就進入中間廢液容器,從而實現(xiàn)細胞分選的目的。

因此流式細胞計可同時檢測單個細胞DNA、RNA、細胞體積等參數(shù),進行細胞周期與細胞凋亡的研究;并可分析細胞表面或細胞內的各種抗原、蛋白、酶、細胞因子和粘附分子以及基因表達產物;還可在無菌條件下,以高速對活細胞進行分類收集,其純度達90~99%。此外還可應用于酶活性、細胞內和細胞膜受體、表面電荷、細胞內pH、細胞和線粒體膜電位、細胞漿和膜結合的鈣離子、膜的完整性、流動性、通透性或微粘度等功能研究。

第十一節(jié) 組織培養(yǎng)與細胞培養(yǎng)技術

組織與細胞培養(yǎng)(tissue and cell culture)是將活體內部分組織細胞取出后在人工條件下使其生長,繁殖和傳代。在體外對細胞進行生命活動、細胞癌變等問題研究。還可施加實驗因子進行形態(tài)、生化、免疫、分子生物學觀察,已廣泛應用于病理學的各個研究領域。

原代培養(yǎng):由體內直接取出組織或細胞進行培養(yǎng)。優(yōu)點:離體時間短,遺傳性和體內組織相似。宜作細胞形態(tài)、機能和分化研究。

傳代培養(yǎng):把細胞自原代培養(yǎng)的培養(yǎng)瓶中分離、稀釋而移至另一新的培養(yǎng)瓶中的操作程序即為傳代或再培養(yǎng)。以便持續(xù)培養(yǎng),得到大量同種細胞,或建成細胞株,維持細胞種延續(xù)(圖18-17)。

圖18-17培養(yǎng)細胞

左圖 食管癌細胞系培養(yǎng)  右圖  體外神經干細胞培養(yǎng)

第十二節(jié) 形態(tài)測量與圖像分析術

病理圖像分析包括定性和定量兩個方面,以往由于技術所限,常規(guī)病理形態(tài)學觀察基本上只能定性。圖像的定性分析是指用肉眼、顯微鏡等觀察圖像后對圖像的結構特點、含義進行描述、分析、推理和判斷。缺乏精確的定量標準和方法。

形態(tài)測量(morphometry)與圖像分析技術(image analysis)是隨著顯微測量與電子計算機技術的進步所發(fā)展的圖像量化分析技術。目前常用方法有:

一.目鏡測微器定量分析

目鏡測微器定量分析是指利用目鏡測量器對特征物(即待測的某種結構)進行二維圖像測量,求出特征物的面積、長度和數(shù)目等,繼而根據(jù)二維圖像與三維結構的數(shù)學關系進行計算,最后得出特征物的三維結構參數(shù)。測量的種類有:網(wǎng)狀方格、關聯(lián)短線測格、平行等距直線測格。基本測量內容有:

1.點計數(shù):即計數(shù)單位范圍內(如網(wǎng)狀方格內)的測點數(shù)。

2.特征物計數(shù):如輪廓面計數(shù)、粒子計數(shù)。

3.長度測量:如直徑測量、寬度測量、截距測量。

4.二維圖像測量:包括面積、截面測量(平均面積與平均周長)。

二.計算機圖像分析系統(tǒng)

計算機圖像分析系統(tǒng)由硬件和軟件兩部分組成。硬件部分由圖像輸入系統(tǒng)(顯微鏡、攝像機、或掃描儀與數(shù)碼相機)、圖像卡、計算機、顯視器、打印機構成;軟件由圖像處理和分析系統(tǒng)組成。在圖像分析前往往需要先行圖像處理。圖像處理是指對圖像的修飾,通過這種修飾去除圖像的缺陷或不足,如將模糊圖像變?yōu)榍逦鷪D像或以新的圖像形式來表達原圖像。常用圖像定量分析參數(shù):

1.灰度是用于表示數(shù)字圖像上像素的濃淡程度,它以整數(shù)值的形式來表示圖像像素的連續(xù)的濃淡信息,所得的具體值稱為灰度值或灰度級。

2.幾何學參數(shù):包括平面結構參數(shù)和三維結構參數(shù)。

常用平面結構參數(shù)有面積、直徑、周長、長徑、短徑、面積密度、核漿面積比等。

常用三維參數(shù)有密度類參數(shù)、形狀類參數(shù)、分布類參數(shù)。

易混概念

組織與細胞化學和免疫組織與細胞化學技術

前者的原理是細胞中的化學成分和其相應的底物呈一系列的化學反應,形成于顯微鏡下可見到的反應產物如蘇丹Ⅲ法(使中性脂肪著色)、普魯氏藍反應法(顯示含鐵血黃素)、Feulgen法(顯示DNA);而后者是應用抗原與抗體接觸后可形成“抗原-抗體復合物”的化學反應,以檢測組織或細胞內抗原(或抗體)的技術,如PAP、ABC、SABC技術等。

Summary

In this chapter we discussed some important clinicaland experimental methods of pathology. Some of them are typical traditional techniquesincluding histochemistry and cytochemistry technique, tissue and cell culture.The others relate to new developing molecular pathologic methods coveringimmunohistochemistry and immunocytochemistry technique, electron microsocope,confocal laser scanning microscopy, biochip technology, laser micro-desection,in situ hybridization(ISH), chromsome analysis by fluorescence in situhybridization, comparative genome hybridization (CGH), flow cytometry,morphometry and image analysis techniques.

 

 

主要參考文獻

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(汕頭大學 蘇敏)

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